Biologik jarayonlar kinetikasi. Reaksiya tezligiga ta`sir etuvchi omillar. Fermentativ reaksiyalar
![Biologik jarayonlar kinetikasi. Reaksiya tezligiga ta`sir etuvchi
omillar. Fermentativ reaksiyalar
Reja:
1. Kimyoviy jarayonlarning molekulyarligi va tartibi. Gunberg-Vaage
qoidasi.
2. Biologik jarayonlarni matematik modellash prinsiplari.
3. Dinamik sistemalarni tasvirlovchi matematik modellar, ularning
geometrik yechimlari.
4. Kimyoviy jarayonlar tezligiga kontsentratsiyaning ta’siri.
5. Kimyoviy jarayonlar tezligiga haroratning ta’siri.
6. Fermentativ reaksiyalar kinetikasi. Mixaelis-Menten tenglamasi.
7. Fermentativ katalizga pHning ta’siri. Farmakokinetika va tibbiy
fermentoterapiya asoslari.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_1.png)
![Kimyoviy jarayonlarning tezligiga ta’sir etadigan qonuniyatlarni, turli
faktorlarning jarayon tezligiga va mexanizmiga ta’sir etishini kimyoviy kinetika
o‘rganadi. O‘z navbatida kinetikaning ikki bo‘limi o‘zaro farqlanadi:
1) kimyoviy jarayonning borish mexanizmini hisobga olmagan holda uning
tezligini matematik ifodalashni o‘rganadigan bo‘limi – formal kinetika deyiladi;
2) kimyoviy jarayonlarning borish mexanizmlarini o‘rganishga
bag‘ishlangan bo‘limi – molekulyar kinetika deyiladi.
1. Kimyoviy jarayonlarning molekulyarligi va tartibi. Har qanday
kimyoviy jarayonlar ko‘p miqdordagi elementar aktlardan iborat. Reaksiyada
ishtirok etayotgan molekulalarning soni turlicha bo‘lishi mumkin. Reaksiyada
bevosita ishtirok etayotgan molekulalar soni uning molekulyarligini belgilaydi:
Kimyoviy jarayonning elementar aktini (ta’sirlashuvini) hosil qiladigan
molekulalarning eng kichik soni jarayonning molekulyarligi deyiladi va u butun
sonlar qiymatiga teng bo‘ladi.
Kimyoviy jarayonlar bir, ikki va uch molekulyar bo‘lishi mumkin:
1. Bir molekulyar (monomolekulyar) kimyoviy jarayonlarda bitta dastlabki
molekula bir yoki bir necha reaksiya mahsulotiga aylanishi mumkin. Bu quyidagi
umumiy tenglama bilan ifodalanadi:
A→B; A→B+C; A→B+C+D.
2. Ikki molekulyar (bimolekulyar) kimyoviy jarayonlarda dastlabki
mahsulotlar sifatida 2 mol bir xil yoki turli xil moddalar ishtirok etadi.
2A→B+C; A+B→C+D.
3. Uch molekulyar kimyoviy jarayonlarda bir vaqtning o‘zida 3 ta molekula
o‘zaro to‘qnashishi kerak. Bu reaksiyaning ehtimolligi kichik. Shu sababli kam
hollarda kuzatiladi:
2A+B→C
Molekulyarligi uchdan yuqori bo‘lgan reaksiyalar ma’lum emas.
Kinetikada kimyoviy reaksiyalar birinchi, ikkinchi, uchinchi, nolinchi va
kasr tartibli reaksiyalarga bo‘linadi. Reaksiya tartibi reaksiya tezligini ifodalovchi
tenglamadagi reagentlar konsentratsiyasi darajalarining yig‘indisidan iborat](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_2.png)
![kattalik hisoblanadi. Agar reaksiya tezligi reaksiyaga kirishuvchi bitta moddaning
konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lsa, bu reaksiya birinchi tartibdagi reaksiya deb
ataladi:
dP/dt = k[A] 1
(1.1)
Reaksiya tezligi reaksiyaga kirishuvchi ikkita moddaning
konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lsa, bu reaksiya ikkinchi tartibdagi reaksiya deb
ataladi:
dP/dt = k[A] 2
yoki dP/dt = k[A]·[B] 1
(1.2)
Ikkinchi tartibdagi reaksiya ikkinchi tartib kinetika asosida boradi.
dP/dt = k[A] 2
·[B] 3
·[C] 2
reaksiya esa yettinchi tartibli reaksiyadir, chunki
reagentlar konsentratsiyasining yig‘indisi (2+3+2=7) yettiga teng. Kinetik
tenglamada konsentratsiya ko‘rsatilmзagan bo‘lsa, ya’ni tezligi reaksiyaga
kirishuvchi moddalar konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lmasa, bunday reaksiya
nolinchi tartib reaksiya deb ataladi va dP/dt = k
0 ko‘rinishida ifodalanadi.
Gunberg-Vaage qoidasi. Odatda jarayonning molekulyarligi va tartibi bir
bosqichli oddiy reaksiyalardagina o‘zaro mos keladi.
Kimyoviy kinetika nazariyasi asosida kimyoviy reaksiyalar tezligi reaksiya
kirishuvchi reagentlarning faol massasiga proporsionaldir, deb ta’kidlovchi
Gunberg-Vaage fundamental qoidasi yetadi. Bu qoidani reaksiyaning umumiy
tezligini tasvirlovchi ifodaga qo`llash har bir faol massa yoki faollikni
(misolimizda konsentrasiyani) re aksiyaning stexnometrik tenglamasidagi
koeffisiyentiga mos keladi gan darajaga ko’tarishga olib keladi. Eng oddiy misol
sifatida quyidagi reaksiyani olamiz:A k B 1
( mahsulot) .
A moddalilg parchalanish tezligi uning konsentrasiyasiga [A] ga
mutanosibdir, ya’ni : v = d[B]/dt = k
1 [A].
Bordi-yu,
mA + nB ⃗ 2ò ko’rinishidagi reaksiya olinsa, uning tezligi
[A] m
va [B] n
ko’paytirmasiga proporsionan bo’ladi, ya’ni
-dP/dt = k
2 [A] m
[B] n](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_3.png)
![tenglamalardagi propor sionallik koeffisiyenti bo’lmish k
2 - reaksiyaning
tezlik konstantasini ifodalab, u olingan reagentlar konsentrasiyasi birga teng
bo’lgan shartidagi reaksiyaning tezligini aks etitiradi. Tenglamani oldiga
qo’yilgan " -" belgi, reaksiya tezligining vaqt e’tibori bilan ka maya borishini
ifodalaydi. To’g’ri va teskari yo’lalishdagi reaksiyalar tezlik konstantalarining
nisbati k
muv = k
+1 /k
-1 muvozanat konstantasi deb atalib, k
+1 > k
-1 sharoitda, u to’g’ri
reaksiyaning teskari reaksiyadan ustun lik olishini bildiradi.
2. Biologik jarayonlarni matematik modellash prinsiplari. Ochiq biologik
sistemalarning eng muhim o‘ziga xosliklaridan biri, ularda statsionar holatning
(sistema parametrlari doimiyligining) qaror topishidir. Statsionar holatlararo o‘tish
jarayonlarining kinetik tiplari o‘zaro farqlanadi: overshut (oshiqcha chetlashish),
yolg‘on start va tebranmali rejim. Ochiq sistemalarning bunday xossasini oddiy
kirish va chiqish qismlarda klapanlari bor, hamda aks aloqa sistemasi bilan
ta’minlangan suvli rezervuarlardan iborat Barton gidrodinamik modelida namoyish
etish mumkin. Qaysiki, unda o‘sha soddalashtirilgan model tirik hujayradagi
statsionar holatning saqlanishini ta’minlovchi kinetik mexanizmlarning deyarli
hamma analoglari mavjud. Ammo biologik sistemalar hatti-harakatini matematik
modellash muammolari ancha murakkabdir. Quyida biz biologik jarayonlar
kinetikasi hamda ularning muhim xossalarini modellashga doir asosiy qoidalar va
yondashishlarni ko‘rib chiqamiz.
Biologik jarayonlar kinetikasi biofizikaning bir bo‘limi sifatida sistema
tarkibiy qismlari ta’sirlashishlariga doir ma’lum bo‘lgan qonuniyatlar asosida
uning hatti-harakatini zamonda tekshirish bilan shug‘ullanadi. Kinetik sistemani
o‘lchanishi mumkin bo‘lgan kattaliklar orqali ifodalangan vaqtning har bir
momentida, muayyan son kattaliklariga ega bo‘luvchi o‘zgaruvchi kattaliklar va
bir qator parametrlar majmuasi tarzda xarakterlash mumkin. Parametrlar sistema
ustida o‘tkazilayotgan kuzatishlar davomida o‘zgarmasdan saqlanadigan
kattaliklardir, vaqt davomida o‘zgaradigan kattaliklar o‘zgaruvchilardir.
Biologik sistemalardagi o‘zgaruvchi kattaliklarga o‘lchanishi mumkin
bo‘lgan kattaliklar: biokimyoda – metabolitlar konsentratsiyasi, mikrobiologiyada](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_4.png)
![– mikroorganizmlar soni yoki ularning biomassasi, ekologiyada – turlarning soni,
biofizikada – membranada sodir bo‘ladigan jarayonlar, membarana potensiali
kattaligi va hokazo. Parametrlarga esa, harorat, rN, membrananing elektr sig‘imi,
namlik, va hokazolar misol bo‘ladi.
So‘nggi paytlargacha biologiyada qo‘llanilib kelingan matematik modellar
quyidagi ko‘rinishga ega.
dC
1 /dt=f
1 (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t);
dC
2 /dt=f
2 (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t);
……………………………
dC
n /dt=f
n (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t)
Oxirgi natijada masalaning yechimlarini analitik yo‘l bilan hosil qilish
mumkin bo‘lgan chiziqli differensial tenglamalarga borib taqaladi. Bu yerda S
1 (t),
….C
n (t) – sistema o‘zgaruvchi kattaliklarini tasvirlovchi vaqtning noma’lum
funksiyalari (masalan, modda konsentratsiyasi), dC
n /dt – o‘sha o‘zgaruvchi
kattalikning o‘zgarish tezligi f
n – ichki va tashqi omillarga bog‘liq funksiya belgisi.
Ma’lumki, real kimyoviy jarayonlar ikkinchi va undan yuqori tartibga ega
reaksiyalarni o‘z ichiga oladi. Bu tip reaksiyalar tenglamalarining o‘ng tomonidagi
nochiziq hadlar ularning tahlilini ancha murakkablashtirsa ham sistemaning
matematik xossalarini ancha boyitadi.
Dastlabki tenglamalar sistemasini soddalashtirish maqsadida quyidagi
yondoshuvlardan foydalaniladi:
A) Tenglamalar sonini qisqartirish. Sistema statsionar holatlarning bir
qator muhim xossalarini, tenglamalarning aniq analitik yechimlari emas, balki
ularning o‘ng tomon xossalarini tekshirish orqali oshkor etish mumkin. Yuqorida
keltirilgan tenglamalar sistemasidan iborat modellar umumiy xarakterga ega
bo‘lib, muhimi shundaki, tuzilgan model kechayotgan jarayonni to‘la aks ettira
olishi lozim. Boshqacha aytganda, tenglamalar sistemasi modellanuvchi
sistemaning dinamik strukturasiga to‘la mos kelishi kerak. Umuman bunday metod
ko‘pincha ikki tenglamadan iborat modellar bilan ish ko‘rganda yaxshi natija
beradi. Tenglamalar sonini kamaytirish hohish bo‘yicha emas, balki obyektiv](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_5.png)
![qonun-qoidalarga amal qilingan holda bajarilishi lozim. Aks holda obyektning u
yoki bu xil muhim xossasini yo‘qotib qo‘yish bilan modelni nochor va noadekvat
qilib qo‘yishdek xatarga duch kelishimiz mumkin;
B) “Tor joy” prinsipi . Bu prinsip reaksiyalar zanjiridagi eng tuban tezlikda
kechadigan reaksiyani “tor joyni” xarakterlab, bu joyning parametrlari butun bir
sistemaning fe’l-atvorini belgilaydi. Afaqat modellashda, umuman, murakkab
jarayonlarni ularning eng sekin kechadigan sohasiga ta’sir etish juda ham samarali
bo‘lib chiqadi;
S) Iyerarxiyaviy prinsip . Bu prinsip ham har xil tabaqadagi biologik
sistemalarni tahlil etishda ularni soddalashtirishga imkon beradi. Iyerarxiyaviy
sistema deganda, keng ma’noda o‘zaro ta’sirlashuvchi subbirliklar ketma-
ketligidan tashkil topgan ansabl qismlarining ta’sirlanishi tushuniladi. Hatto,
o‘zaro ta’sirlashuvchi reaksiyalar zanjiri doirasida ham tezliklari bilan farqlanuvchi
bosqichlar har doim topiladi. Yaxlit biologik sistemada bir vaqtning o‘zida tez-
kechar fermentativ kataliz jarayonlari (fermentning xarakterli davri, vaqti 0,01-100
ms) fiziologik jarayonlar (xarakterli vaqti - minutlar) va reproduksiya jarayonlari
(xarakterli vaqti – minutlar, soatlar) kechadi.
Matematik modellash amaliyoti shuni ko‘rsatdiki, sistemaning shu xil
soddalashtirilgan tenglamalar sistemasi tekshirish, o‘sha sistemaning umumiy
dinamik xossalarini aks ettiruvchi to‘la modelini tahlil qilishga qaraganda ancha
to‘liq tasavvurlar bera oladi. Bunday hol sistemaning faoliyat sharoiti o‘zgarganda,
uning fe’l-atvori va xarakterini oldindan aytib berishda o‘ta muhim. Kinetik model
fe’l-atvori tekshirilganda, birinchi navbatda statsionar holat xossalari nazarda
tutilishi lozim. Model yechimidan quyidagi savollargajavob izlanadi:
Sistemada statsionar holat mavjudmi?
Ular nechta?
Ularning barqarorlik xarakteri qanday?
Barqarorlikning sistema parametrlariga bog‘liqligi qanday?
Statsionar holat yaqinida sistema o‘zini qanday tutadi?
Ularning o‘tish imkoni bormi?](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_6.png)
![Mazkur masalalarni tekshirish bilan, ayniqsa, tenglamalarni yechmasdan
sistema fe’l-atvorining ko‘rsatib o‘tilgan qonuniyatlarni, tenglamalarning o‘ng
tomon f
1 (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t) xossalari ko‘rinishi bo‘yicha tekshirishga imkon
beruvchi differensial tenglamalar sifati nazariyasi shug‘ullanadi.
Shunday qilib, hozirgi zamon biologik jarayonlar kinetikasi va matematik
modellash sohalaridagi asosiy yondoshuv differensial tenglamalarning analitik
yechimlaridan voz kechib, biologik sistemalar dinamik fe’l-atvorlarining sifatiy
xarakteristikasini olishga erishish hamda fe’l-atvorning sistema xossalarini
belgilovchi parametrlarga bo‘lgan bog‘liqligini aniqlashdan iborat. Mazkur
masalani yechish uchun vaqt omilidan xalos bo‘lish zarur. Bunga statsionar
holatda jarayon tezligining o‘zgarmasligi haqidagi qoidadan foydalanib erishiladi,
ya’ni
dC
i /dt=0; i=1, 2, 3….n (2).
Shu munosabat bilan tenglamalarning so‘l tomoni nolga teng qilinib,
diferensial tenglamalar algebraik tenglamalarga aylantiriladi, ya’ni
dC
1 /dt=f
1 (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t)=0;
dC
2 /dt=f
2 (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t)=0;
……………………………
dC
n /dt=f
n (C
1 ,C
2 ,C
3 …..C
n ,t)=0. (3).
3. Dinamik sistemalarni tasvirlovchi matematik modellar, ularning
geometrik yechimlari. Dastlab model va modellashtirish terminlarining mohiyatini
tushunib olsak. Turli bilim sohalarida real sistemalarni va jarayonlarni tekshirishda
modellardan foydlaniladi.
Model – aql bilan ko‘ra bilish yoki moddiy jihatdan joriy qilingan, istalgan
tabiatli obyekt bo‘lib, u ta’qiq qilish yoki o‘rganish kerak bo‘lgan hodisalarni,
jarayonlarni va sistemalarni keltirib chiqaradi. Hodisalarni, jarayonlarni va
sistemalarni tadqiq qilishda ularning modellarini yasash va o‘rganishga asoslangan
usul modellashtirish nomini olgan.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_7.png)
![Shunday qilib, hozirgi vaqtda modellashtirish deganda, planerning
modelini yaratish kabi buyumlarnig nusxasini ko‘chiruvchi buyumli modellashgina
tushunilmay, balki hodisalarning va obyektlarning chuqur mazmunini bilishning
ilmiy tadqiqot olib borishdagi ilmiy metodi deb qaraladi. Modellashtirishning asosi
moddiy dunyoning va materiyaning atributlari – fazo va vaqt, shuningdek,
materiyaning harakat prinsiplarining birligidadir.
Odatda bir qancha modellarning bir necha turlari (geometrik, biologik,
fizik-kimyoviy, matematik) tafovut qilinadi. Ularga qisqacha to‘xtalib o‘tish
maqsadga muvofiqdir.
Geometrik modellar – modellarning eng sodda turi bo‘lib, bu aslidan tashqi
ko‘rinishning nusxasidir. Anatomiya, biologiya va fiziologiyani o‘qitishda
foydalaniladigan mulyajlar, geometrik modellardir.
Biologik (fiziologik) modellarni yaratishdan maqsad laboratoriya sharoitida
sinalayotgan hayvonlarda ma’lum bir kasallik holatini aks ettirishdir. Tajribada
kasallikning kelib chiqish mexanizmlari, uning o‘tishi, organizm holatini
o‘zgartirish uchun zarur bo‘lgan ta’sirlar o‘rganiladi. Bunday modellarga sun’iy
hosil qilingan infeksion (yuqumli) jarayonlar, organlarni gipertroflash, genetik
buzilishlar, zararli o‘simtalar, sun’iy nevroz holati yaratish va har xil emotsional
holatlar kiradi. Bunday modellarni yaratish uchun tajriba tajriba o‘tkaziluvchi
organizmda har xil ta’sir qilinadi: mikroblar bilan zararlash, gormonlar kiritish,
ovqat tarkibini o‘zgartirish, periferik nerv sistemalariga ta’sir qilish, yashash
sharoitini o‘zgartirish kabi ta’sir qilinadi. Biologik modellar yaratish biologiyaning
barcha sohalari va meditsina uchun muhim ilmiy tadqiqotlar olib borish uchun
sharoit yaratadi.
Fizik va fizik-kimyoviy modellarning yaratilishi fizik va kimyoviy usullar
yordamida biologik tuzilmalarni, funksiyalarni yoki jarayonlarni yaratishga
asoslangan. Fizik-kimyoviy medellar biologik modellarga qaraganda, ko‘proq
ideallashtirilgan bo‘lib, modellashtirilayotgan biologik modellarga juda kam
o‘xshaydi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_8.png)
![Matematik modellar eksperimental ma’lumotlar asosida (moddiy yoki
predmetli modellash) yoki mushohada qilish yo‘li bilan gipotezadan yoki biror
hodisaning ma’lum qonuniyatidan foydalangan holda yasaladi. Bunda ikkinchi,
nazariy modellash tajriba asosida tekshirib ko‘rishni talab qiladi.
Nazariy modellashtirishlar tajriba o‘tkazish nihoyatda qiyin yoki umuman
mumkin bo‘lmagan holda ayniqsa foydalidir. EHM da eksperimental ishlab
chiqarilishi qiyin bo‘lgan biologik jarayonning matematik modellarini har xil
variantlarda yechish jarayonlarning sharoitga qarab o‘zgarishini, yangi
hodisalarning kelib chiqishini oldindan ko‘ra olish imkonini beradi. Masalan,
relaksatsion tebranishlar nazariyasiga asoslangan yurak yurak faoliyati modelini
tadqiq qilish odamda yurak ritmining buzilishini oldindan ko‘ra bilish imkoniyatini
taqdim qildi. Keyinchalik bu o‘z tasdig‘ini to‘la topdi.
Ko‘p hollarda fizik jihatdan turlicha bo‘lgan modellar uchun bir xil
differensial tenglamalar kelib chiqadi. Masalan so‘nuvchi mexanik bo‘lgan va
elektr tebranishlar bir xil differensial tenglama bilan ifodalanadi. Bunday hol
o‘xshashliklardan matematik modellarga keng foydalanish imkoniyatini yaratadi,
tegishli modellar esa to‘g‘ridan-to‘g‘ri o‘xshashliklarning predmetli modellari deb
ataladi.
Tabiatda sodir bo‘ladigan fizik va biologik jarayonlarni matematik
modellashtirish asosida o‘rganish to‘rt bosqichga bo‘linadi.
Birinchi bosqich modellashtiriladigan obyektlarni ajratish va ularni
bog‘lovchi qonuniyatlarni ifodalashdan iborat. Bu bosqichda modellashtirilayotgan
obyektlar o‘rtasidagi bog‘lanishlarni matematik terminlar asosida yozib chiqish
bilan tugaydi.
Ikkinchi bosqichda matematik modeldan kelib chiqadigan matematik
masalalar tadqiq qilinadi. Bu bosqichning asosiy maqsadi to‘g‘ri masalani yechish,
ya’ni tajriba yoki kuzatishlar natijasi bilan taqqoslash mumkin bo‘lgan
ma’lumotlar olishdir. Qo‘yilgan masalalarni hal qilish uchun miqdoriy axborotni
olishga imkon beruvchi matematik apparat va hisoblash texnikasidan
foydalaniladi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_9.png)
![Uchinchi bosqich ilgari surilgan gipotetik model amaldagi mezonga qay
darajada to‘g‘ri kelishini aniqlashga imkon beradi. Bu masalaning hal qilinishi
nazariy natijalar bilan eksperiment natijalarining bir-biriga mos kelishi bilan
bog‘liq bo‘ladi. Bu bosqichda ko‘pincha teskari masalalar yechiladi. Bu bilan
chiqayotgan natijalar bilan taqqoslash asosida modelning oldin noma’lum bo‘lgan
ba’zi xarakteristikasi topiladi.
To‘rtinchi bosqichda model haqidagi malumotlarni twplash va uni
modernizatsiya qilish natijasida modelni analiz qilish kiradi.
Dinamik sistemalarning differensial tenglamalari . dx/dt=f(x) shakldagi 1-
tartib differensial tenglamalar, ko‘pgina biologik jarayonlarni tasvirlashga qodir
bo‘lsada, ularning monoton yechimlari davriy jarayonlarni tasvirlay olmaydi.
Shuning uchun biologik jarayonlar kinetikasida 1-tartib ikkita differensial
tenglamalar vositasida tasvirlanadigan modellar keng qo‘llaniladi. Masalan, ikki
differensial tenglamadan iborat “yirtqich-ov” modelidagi o‘zgaruvchilar (x, y) jufti
sistemaning ma’lum bir holatini tasvirlaydi. Koordinata o‘qlaridan hosil bo‘lgan
o‘zgaruvchi x, y kattaliklari tushiriladigan tekislikni ko‘zdan kechiramiz.
Mazkur tekislikdagi koordinatasi x,y bilan belgilanadigan har qanday M
nuqta, sistemaning muayyan bir holatini aks ettiradi. Faza tekisligidagi nuqta
fazoviy trayektoriya bo‘ylab fazoviy tezlik bilan harakatlanadi. Mazkur tezlik esa,
fazoviy tayektoriyaning (integral chiziqning) muayyan bir nuqtasi orqali
o‘tkazilgan urinmaning og‘ish burchagi dy/dx ga teng.
Faza tekisligidagi M(x,y) tip nuqtalarning o‘zaro ulangan majmuasidan
fazoviy trayektoriya shakllanadi. O‘z navbatida faza tekisligidagi yuarcha fazoviy
trayektoriyalar majmuasidan sistemaning fazoviy portreti hosil bo‘ladi.
Sistemaning “portreti” esa, dastlabki shartlarga bog‘liq holda yuz beradigan
o‘zgarishlarni payqashga imkon beradi. Ko‘p hollarda tipidagi tenglamalar
sistemaning analitik yechimlaridan voz kechib, ularning faqat ko‘rinishi bo‘yicha
fazoviy portretlar tuzish mumkin bo‘ladi. Bunday hollarda ikkinchi o‘zgaruvchilar
bilan ish ko‘riladi. Shunday qilib, ikki differensial tenglamadan iborat model
dx/dt=P(x,y)](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_10.png)
![dy/dt=Q(x,y)
ko‘rinishga ega bo‘lib, bu yerda P(x,y) va Q(x,y) lar evklid tekisligining
ba’zi bir S sohasidagi uzluksiz fuknsiyalardir. Mazkur S soha cheklangan va
cheklanmagan bo‘lishi mumkin. Agarda x va y biologik ma’noga ega bo‘lsa,
masalan, modda konsentratsiyasi, turlar soni ularga ma’lum cheklanishlar
qo‘yiladi, ya’ni ular manfiy bo‘la olmaydi, individlar soni kasr tarzida
ifodalanmaydi va hokazo. Bunday modellarga Volterra-Lotka modeli misol bo‘lib,
u quyidagicha tasvirlanadi:
dx/dt=K
1 x-K
2 xy)
dy/dt=K
2 xy-K
3 y
Avtotebranmali jarayonlar . Glikoliz va fotosintez oraliq mahsulotlarining
tebranib turishi hamda biologik “soat” asosida yotgan biokimyoviy reaksiyalar
davriyligini tekshirish natijasida tebranmali biologik jarayonlarga bo‘lgan qiziqish
ancha kuchaydi. Tebranmali o‘zgarishlarga barcha hollarda ham qandaydir tashqi
ta’sir emas, balki sistemaning o‘z ichki dinamik xossalari sabab bo‘ladi. Bunday
sistemalar avtotebranmali sistemalar deb ataladi. Davriy tebranishga faza
tekisligidagi berk egri chiziq mos keladi. Agarda mazkur berk egri chiziq
izolirlangan bo‘lsa, unga tashqari yoki ichkaridan qo‘shni trayektoriyalar spiral
bo‘lib yaqinlashsa, bunday izolirlangan trayektoriya barqaror cheklovchi sikl
hisoblanadi. Sistema uncha katta bo‘lmagan halayon holatiga keltirilganda, u bari
bir sikl trayektoriyasiga qaytadi. Uni umuman beqaror hisoblanadigan “markaz”
alohida nuqta atrofidagi trayektoriyadan farqlanuvchi muhim o‘ziga xoslik ham
aynan mana shunda. Cheklovchi siklning trayektoriya bo‘ylab harakatlanish davri
va tebranish amplitudasi boshlang‘ich shartlarga bog‘liq bo‘lmaydi.
1. Kimyoviy jarayonlar tezligiga kontsentratsiyaning ta’siri. Reaksiya
tezligi reaksiyaga kirishuvchi moddalar konsentratsiyasining vaqt birligi davomida
o‘zgarishlari bilan belgilanadi. Reaksiyada ishtirok etuvchi moddalar
konsentratsiyalari hajm birligidagi modda miqdorini ifodalaydi. Boshlang‘ich](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_11.png)
![moddalar konsentratsiyasi vaqt davomida kamayib boruvchi qiymatga, hosil
bo‘luvchi moddalar konsentratsiyasi esa ortib boruvchi qiymatga ega bo‘ladi.
Kimyoviy reaksiyada haqiqiy va o‘rtacha tezlik qiymatlari farqlanadi. Agar
modda konsentratsiyasining cheksiz qisqa vaqt dt davomida o‘zgargan cheksiz
kichik miqdorini dC bilan belgilasak, unda reaksiyaning haqiqiy tezligi
quyidagicha ifodalanadi:
V = dC/dt 1
(1.3)
Kimyoviy reaksiyada moddaning konsentratsiyasi t
1 qiymatdan t
2
qiymatga qadar o‘tgan ma’lum bir vaqt ichida C
1 dan C
2 gacha o‘zgarganda,
kimyoviy reaksiyaning o‘rtacha tezligi quyidagicha ifodalanadi.
V
o’rt = C
1 - C
2 /t
2 – t
1 1
(1.4)
Kimyoviy reaksiya tezligini ifodalovchi grafik.
Kimyoviy reaksiya tezligiga reaksiyaga kirishayotgan dastlabki
moddalar xossalari, reagentlar konsentratsiyasi, harorat, bosim, katalizator va
ingibitor moddalar, yorug‘lik, muhitning rN- ko‘rsatkichi kabi omillar kuchli ta’sir
ko‘rsatadi. Reaksiya tezligiga reaksiyaga kirishayotgan dastlabki moddalarning
konsentratsiyasi o‘zgarishlarining ta’siri quyidagicha tushuntiriladi. Reaksiya
muhitida to‘qnashayotgan zarrachalar konsentratsiyasining ortishi to‘qnashuvlar
sonining ortishiga olib keladi va natijada reaksiya tezligi ortadi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_12.png)
![Kimyoviy reaksiya tezligiga reaksiyaga kirishayotgan moddalarning
konsentratsiyalari o‘zgarishining ta’siri 1867 yilda norvegiyalik olimlar
K.Guldberg va P.Vaage tomonidan o‘rganilgan.
Kimyoviy reaksiya tezligi reaksiyaga kirishayotgan moddalarning
konsentratsiyasiga to‘g‘ri proporsional.
Bu qonunga muvofiq, A+B C ko‘rinishda amalga oshuvchi
kimyoviy reaksiyada reaksiya tezligi quyidagicha ifodalanadi:
V = k [A]·[B]
Bu yerda: v – kimyoviy reaksiya tezligi; [A], [B] – kimyoviy reaksiyaga
kirishayotgan A va V moddalarning mol /l bilan ifodalangan konsentratsiyasi; k –
tezlik konstantasi hisoblanib, agar A = V = 1 bo‘lsa, u holda v = k ga teng bo‘ladi.
Demak, k – qiymat reaksiyaga kirishayotgan moddalarning
konsentratsiyasi 1 mol/l ga teng bo‘lgan holatdagi reaksiya tezligi, ya’ni
solishtirma tezlik hisoblanadi. k ning qiymati reaksiyaga kirishuvchi reagentlar
tabiatiga, haroratga va katalizatorlar ishtirokiga bog‘liq bo‘lib, moddalar
konsentratsiyasiga bog‘liq emas.
Kimyoviy reaksiyalarda reaksiyaga kirishuvchi atom va molekulalarning
qo‘zg‘alish holatiga o‘tishi natijasida ularning reaksiyaga kirishish faolligi ortadi.
Bu zarrachalarni qo‘zg‘alish holatiga o‘tkazish uchun reaksiya muhiti haroratini
oshirish talab etiladi.
2. Kimyoviy jarayonlar tezligiga haroratning ta’siri. Harorat ortgan sari
kimyoviy jarayon tezligi va tezlik doimiyligi qiymati ko‘pincha ortadi. Chunki
harorat oshirilganda, reaksiyaga kirishuvchi moddalarning faolliklari ortib,
ularning to‘qnashishlari soni ko‘payishiga olib keladi. Bu esa, o‘z navbatida
reaksiyaning tezligi ortishiga ta’sir ko‘rsatadi. Masalan, vodorod va kislorod
atomlari o‘rtasidagi reaksiya natijasida suvning hosil bo‘lishi 400 0
S da 1920 soat,
500 0
S da 2 soatni talab qilsa, 600 0
S da portlash bilan kechib, juda qisqa vaqt
ichida sodir bo‘ladi.
Kimyoviy reaksiya tezligining harorat o‘zgarishlariga bog‘liqligini dastlab
Y.G. Vant-Goff tajribalar asosida aniqlagan va quyidagi sharhlagan:](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_13.png)
![Gomogen kimyoviy jarayonlarning harorati har 10 o
S ga oshirilganda,
kimyoviy reaksiya tezligi 2-4 (o‘rtacha 3) martaga ortadi.
Bu qonunning matematik ifodasi quyidagicha: γ= kt+10
kt
= vt+10
vt
≈3
V
t
2
¿ = V
t 1 ∗ γ t 2 − t 1
10 ¿
k
t
2
¿ = k
t 1 ∗ γ t 2 − t 1
10 ¿
Bu tenglamada v
t1 va k
t1 - boshlachg‘ich haroratda (t
1 ) kuzatiladigan jarayon
tezligi va uning doimiysi; v
t2 va k
t2 harorat orttirilgandan so‘ng (t
2 ) kuzatiladigan
jarayon tezligi va uning doimiysi; γ-Vant-Goff (harorat) koeffitsiyenti.
Tirik organizmda sodir bo‘ladigan jarayonlarning borish tezligi ham
haroratga bog‘liq bo‘ladi. Biokimyoviy jarayonlar uchun γ qiymati asosan 1,5-3
oralig‘ida bo‘ladi. Shu sababli kasallik natijasida tana harorati 36,6 dan 39,5 0
S
gacha ko‘tarilsa, biokimyoviy jarayonlar tezligi 1,13-1,39 marta ortib, og‘ir
oqibatlar kelib chiqishiga olib keladi.
3. Fermentativ reaksiyalar kinetikasi. Organizmda kechadigan
biokimyoviy va fiziologik jarayonlar fermentlar ishtirokida amalga oshadi.
Fermentlar strukturaviy tuzilishiga ko‘ra bir komponentli (pepsin, tripsin, amilaza)
va ikki komponentli fermentlarga bo‘linadi. Ikki komponentli ferment
molekulasida kofaktor deb ataluvchi qo‘shimcha molekula guruhi mavjud bo‘ladi.
Ferment molekulasi dializ qilinganda kofaktor qism ferment molekulasidan to‘liq
ajralmaydi. Kofaktorning ferment molekulasi bilan bog‘langan qismi prostetik
guruh deb ataladi. Ikki komponentli fermentning oqsil qismi apoferment,
qo‘shimcha molekula qismi koferment deb nomlanadi. Apoferment koferment](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_14.png)
![qism bilan birikkan holatda ferment to‘la faollikka ega ferment – xoloferment hosil
qiladi.
Fermentlar hujayrada metabolizm jarayonida moddalar o‘zgarishi va
reaksiya mahsulotlarining hosil bo‘lish tezligiga kuchli ta’sir etadi. Fermentativ
kataliz jarayonining energetik xususiyatlarini o‘rganish muhim biologik ahamitga
ega bo‘lib, bu organizmda kechuvchi moddalar almashinuvi dinamik o‘zgarishlari
mexanizmlarini oydinlashtirish imkonini beradi.
Fermentativ reaksiyalar kinetikasi substrat, ferment va reaksiya mahsuloti
hosil bo‘lishi jarayonlari o‘rtasidagi bog‘lanishni differensial tenglamalar orqali
ifodalashdan iborat. Bunda ushbu jarayonda ferment-substrat kompleksi, yoki
Mixaelis kompleksi hosil bo‘lish mexanizmining bosqichlarini o‘rganishga katta
e’tibor qaratiladi. Bu fermentativ jarayonlarni ingibitor, ya’ni susaytiruvchi va
aktivator, ya’ni faollashtiruvchi moddalar yordamida boshqarish imkonini beradi.
Tirik organizmda reaksiyalarning o‘tish tezligi katalizatorlar, fermentlar,
ingibitorlar va reaksiya sharoitiga bog‘liq. Fermentativ kinetika kimyoviy
kinetikaning bir bo‘limi bo‘lib, reaksiya tezligini, reaksiyaga kirishuvchi moddalar
xossalarini va tashqi omillarni fermentativ jarayonlarga ta’sir etish qonuniyatlarini
o‘rganadi.
4. Mixaelis-Menten tenglamasi. Fermentativ reaksiyaning eng yuqori
tezligida ( v
max ) ferment substratga to‘yingan bo‘ladi. Bunda ferment-substrat
kompleksi hosil bo‘ladi. Bu g‘oyani 1913 yilda L.Mixaelis va M.Mentenlar
rivojlantirib, fermentlar ta’sirining umumiy nazariyasini yaratdilar. Ushbu
nazariyaga muvofiq ferment o‘zining substrati S bilan nisbatan tez va qaytar
bog‘lanadi:
E + S ↔ ES
Oddiy fermentativ reaksiyada bitta substrat va bitta mahsulot bo‘lgan
holatda bu jarayonni umumiy ko‘rinishda quyidagicha ifodalash mumkin:](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_15.png)
![Bu yerda : S – substrat;
E – ferment;
k
1 ,
k
-1 – substrat-ferment kompleksi xosil bo‘lishida
to‘g‘ri va teskari reaksiya konstantalari.
Keyingi bosqichda esa, ferment–substrat kompleksi reaksiya
mahsuloti va erkin fermentni hosil qiladi.
Bu yerda, R - reaksiya mahsuloti;
k
2 – reaksiya mahsulotining hosil bo‘lish tezligi konstantasi.
Bu ko‘rinishdagi fermentativ reaksiyada mahsulot kam miqdorda
bo‘lgan holatlarda jarayon qaytmas ko‘rinishda kechadi. Ferment–substrat
kompleksining parchalanishining konstanta qiymatini o‘rganish bu jarayon bir
necha bosqichda amalga oshuvchi jarayonlar yig‘indisidan iborat ekanligini
ko‘rsatadi va quyidagicha ifodalanadi:
Δ [S]/ Δ t = - k
1 [S][E ] + k
–1 [ES]
Δ [E]/ Δ t = - k
1 [S][ E] + k
–1 [ES] + k
2 [ES]
Δ [ES]/ Δ t = k
1 [S][E] - k
–1 [ES] - k
2 [ES] ,
Δ [P]/ Δ t = k
2 [ES]
Tizimdagi ikkinchi va uchinchi tenglamalarni birlashtirib, umumiy ferment
miqdorining o‘zgarmasligini (saqlanishini) quyidagi tenglama yordamida
ifodalash mumkin:
Δ / Δ t ([E] + [ES]) = 0, ёki [E] + [ES] = [E
0 ] = const.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_16.png)
![Yopiq tizimda substrat va mahsulot massasi [S] + [ES] = const
holatda bo‘ladi. Bunda (1.9) tenglamalar tizimi quyidagi ko‘rinishga keladi:
Δ [E]/ Δ t = - [ES]/ Δ t
E = E
0 – (ES) tenglama bilan belgilab olsak, 1.9 tenglamalar tizimida
(oxirgi to‘rtinchi tenglama) mahsulot o‘zgarishi ES o‘zgaruvchan qiymat bilan
aniqlanadi. Ushbu holda [S] va [ES] o‘zgaruvchan qiymatlar uchun 1.9 to‘rtta
tenglama o‘rnida ikkita differensial tenglama qo‘llash mumkin.
d [S]/ d t = -k
-1 [S][E
0 - (ES)] + k
-1 [ E S] ,
d [ E S]/ d t = k
-1 [S][E
0 - (ES)] - k
-1 [ E S] - k
2 [ES] .
Agar o‘lchamsiz kattaliklarni kiritsak:
x = [ES]/[E
0 ]; y = [S]/[S
0 ]; τ = k
2 [E
0 ]t/[S
0 ]; k
-1 /k
2 = n.
Bunda ikkinchi tenglama o‘ng va chap qismlarini k
1 [S
0 ]/k
2 = m
qiymatga bo‘lsak, unda quyidagi tenglama hosil bo‘ladi:
Δ y/ Δτ = nx – my (1 - x);
[E
0 ] Δ x/[S
0 ] Δτ = my (1 –x ) - ( n +1)x;
Tizimda ferment–substrat kompleksi [ES] konsentratsiyasi yetarliligi
vaqt kesimi bo‘yicha xususiyatlarini ko‘rib chiqadigan bo‘lsak, (3.15) tenglamani
kvazistatsionar holatda deb hisoblab, tenglama ikkinchi qismini algebraik
ko‘rinishda quyidagicha ifodalash mumkin:
my (1 – x 1
) – (n + 1 1
) = 0
Bu erda: x 1
= y / y + ( n +1 ) / m
ё ki x 1
= y/y + ( k
-1 + k
2 )/[S
0 ] k
1
K
m = ( k
-1 + k
2 )/ k
1](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_17.png)
![Bu qiymat fermentativ katalizda muhim hisoblanib, Mixaelis-Menten
konstantasi deb ataladi.
Bu ko‘rinishda k
-1 va k
2 - birinchi tartibli konstanta, k
1 – esa ikkinchi
tartibli konstanta, K
m – konsentratsiya o‘lchamlilik xususiyatini ifodalaydi.
t -1
/(C -1
t -1
) = [C]
Agar ushbu qiymat yuqori kvazistatsionar tenglamalar ferment-
substrat [ES] konsentratsiyasiga nisbatan qo‘llanilsa, unda quyidagi tenglama xosil
bo‘ladi:
[ES] = E
0 S/(K
m + S) 1
Fermentativ reaksiya tezligi, ya’ni reaksiya mahsuloti hosil bo‘lishi
yoki substrat miqdorining kamayishi tenglamaning to‘rtinchi qismi asosida
quyidagicha ifodalanadi:
v = - Δ S/ Δ t = Δ P/ Δ t = K
2 E
0 S/K
m + S = v
0 S/K
m + S
Bu tenglama Mixaelis - Menten tenglamasi deb ataladi.
Ushbu tenglama asosida fermentativ reaksiyada substrat – S
konsentratsiyasi 0 dan cheksiz qiymat tomonga qadar oshirilishi reaksiya tezligini
0 dan cheksiz qiymatgacha ortishiga olib keladi va bu holat quyidagicha
ifodalanadi:
v
0 = k
2 E
0
Quyidagi rasmda fermentativ reaksiya tezligining substrat
konsentratsiyasiga bog‘liq o‘zgarishi tasvirlangan:](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_18.png)
![Fermentativ reaksiya tezligining substrat konsentratsiyasiga bog‘liq
o‘zgarishini ifodalovchi egri chiziq.
Bu yerda: v
max /2 - reaksiya maksimal tezligining yarmi; K
M –
Mixaelis konstantasi.
Bu egri chiziq fermentativ reaksiya tezligining substrat
konsentratsiyasiga bog‘liqligini ifodalaydi va Mixaelis giperbolasi deb ataladi.
K
M = S ga teng bo‘lgan holatda fermentativ reaksiya tezligi V/2 teng
bo‘lishi kelib chiqadi.
Shunday qilib, Mixaelis konstantasi fizik ma’nosiga ko‘ra va son
miqdori holatiga ko‘ra substrat konsentratsiyasiga teng bo‘lib, fermentativ
reaksiyaning barqaror tezligi o‘zining maksimal tezlik qiymati yarmisiga umumiy
ferment miqdorining yarmi substrat bilan [ES] kompleks hosil qilgan holatda
erishadi.
Biologik tizimlarda Mixaelis konstantasi reaksiya konsentratsiyasi
birinchi tartibda amalga oshuvchi fermentativ jarayonlar uchun qo‘llaniladi. Bunda
ushbu tizimlarda fermentativ reaksiyalarda K
M ning qiymati 1 dan 10 -8
M gacha
intervalda amalga oshadi. Masalan, bu qiymat laktatdegidrogenaza uchun K
M = 3,5 .
10 -5
M ga, maltaza uchun K
M = 2,1 .
10 -1
M ga teng.
Fermentativ reaksiyalarning tezligi effektorlar (aktivatorlar va ingibitorlar)
ta’sirida o‘zgarishi mumkin. Aktivatorlar ferment molekulasi bilan birikib, uning
faolligini oshiradi. Ingibitorlar esa fermentning faolligini qaytar yoki qaytmas
ingibirlanishiga olib keladi. Bunda ingibitor ferment molekulasining faol markazi
bilan birikma hosil qiladi va substrat bilan konkurent sifatida ta’sirl ashadi. Bu
jarayon quyidagicha ifodalanadi:
Bu yerda: I – ingibitor; EI – ferment – ingibitor
kompleksi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_19.png)
![Bu holatda fermentativ reaksiya tezligini ifodalovchi Mixaelis
tenglamasi quyidagicha ifodalanadi:
v = v
0 S / (K
m + S + k
1 I)
Agar ferment molekulasi substrat bilan ham, ingibitor bilan ham
kompleks hosil qilsa, u holda konkurent bo‘lmagan, allosterik ingibirlanish yuzaga
keladi va reaksiya mahsuloti hosil bo‘lish tezligi quyidagicha ifodalanadi:
v = v
0 S / (K
1
m + S) (1 + k
1 I)
Mixaelis tomonidan asoslab berilgan fermentativ kataliz jarayoni
amalga oshish mexanizmi quyidagi tarzda kechadi. Kimyoviy reaksiyalar amalga
oshishida muhim tushunchalardan biri reaksiyaga kirishuvchi zarrachalarni faol
holatga o‘tkazish hisoblanadi. Buning uchun ma’lum bir qiymatga ega energiya
talab qilinadi va bu faollanish energiyasi deb ataladi. Bu energiya kJ mol –1
yoki
eV hisobida ifodalanadi. Quyidagi:
ko‘rinishida ifodalangan reaksiyaning faollanish energiyasi rasmda
tasvirlangan holatda amalga oshadi:
Kimyoviy reaksiya davomida boshlang‘ich moddalar (A, V) va
reaksiya mahsulotlari (S, D) energiyasining o‘zgarishlari va faollanish
energiyasining ko‘rinishi.
Bu yerda E
1 –reaksiya tizimining reaksiyadan oldingi umumiy energiya
qiymati; E
2 – reaksiyadan keyingi umumiy energiya qiymati; E*
1 – to‘g‘ri](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_20.png)
![reaksiyaning faollanish energiyasi; E*
2 – teskari reaksiyaning faollanish
energiyasi; Q = E
1 -
E
2 – reaksiyaning issiqlik effekti; K – faollanish energiyasi
yoki «energetik tusiq» ni ifodalaydi.
Tizim E
1 holatdan E
2 holatga bevosita emas, o‘z energiyasini K
qiymatga yetkazish orqali o‘tadi. Ya’ni K - «energetik to‘siq» ni yengib o‘tishi
talab etiladi.
Fermentativ katalizning reaksiya tezligiga ta’sir mexanizmi faollanish
energiyasini ferment kamaytirishi orqali tushintiriladi va bu holat quyidagicha
ifodalanadi (rasm. 1.4):
Ferment katalizator ishtirok etmagan (1) va ishtirok etgan (2)
reaksiyalar energiyasining reaksiya davomida o‘zgarishlarini ifodalovchi egri
chiziq.
Bu yerda: Δ G – reaksiya tizimida erkin energiyaning standart o‘zgarishi;
S – boshlang‘ich substrat;
P – reaksiya mahsuloti;
E (1) va E (2) – tegishli reaksiyalarning faollanish
energiyasining umumiy qiymati;
Δ E – E (1) va E (2) birinchi va ikkinchi reaksiyalarda
faolanish energiyalari o‘zgarishi o‘rtasidagi farqni ifodalaydi.
Bu ko‘rinishdagi tizimda ferment reaksiya faolligi energiyasi o‘zgarishi Δ E
qiymatini kamaytiradi va natijada reaksiya tezligi ortadi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_21.png)
![Ushbu jarayonda ferment molekulasi substrat bilan qulf-kalit mosligi
asosida yoki Koshland ta’riflagan qo‘l-qo‘lqop mosligida mutanosib birikma xosil
qiladi va bu quyidagicha ifodalanadi (rasm. 1.5):
Fermentativ reaksiyada ES kompleksi hosil bo‘lish mexanizmining
sxematik tasviri.
Fermentativ reaksiyada ferment-substrat kompleksi hosil bo‘lishi
ferment molekulasida konformatsiya o‘zgarishlari orqali tushuntirilib, bunda
dastlab ma’lum bir vaqt davomida mavjud bo‘luvchi, beqaror kompleks SE* hosil
bo‘lishi, so‘ngra barqaror kompleks E 1
P hosil bo‘lishi yuz beradi.
Bu jarayonni quyidagicha ifodalash mumkin:
S + E SE* E 1
P
Bu yerda: E* -beqaror holat; E 1
– ferment oqsil globulasining
barqaror konformatsiya o‘zgarishlarini ifodalaydi.
5. Fermentativ katalizga pH ning ta’siri . Fermentativ reaksiyalar tezligiga
muhitning pH-ko‘rsatkichi, harorat kabi bir qator omillar kuchli ta’sir ko‘rsatadi.
Fermentning eng yuqori katalitik faolligini ta’minlaydigan pH qiymat
chegaralari fermentativ katalizning pH optimumi deyiladi. Muhit pH qiymati
hisobiga kelib chiqadigan ferment faolligining o‘zgarishi quyidagilarga ham
bog‘liq:
1. Muhit pH ning o‘zgarish hisobiga fermentlarning faol markazidan
uzoqda joylashgan funksional guruhlarning xossasi o‘zgarishi mumkin. Shu
sababli ulardagi holat o‘zgarishlari fermentning faol markazlarida konformatsion](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_22.png)
![(fazoviy joylashuv) o‘zgarishlarini keltirib chiqarishi va faollikka ta’sir etishi
mumkin.
2. Ferment bilan ta’sirlashayotgan substratning reaksiya markazida
o‘zgarish sodir bo‘ladi. Jumladan, protonlanish yoki proton yo‘qotish hisobiga
substratning funksional guruh tabiati, konformatsiyasi, elektron zichligi va boshqa
xossalari o‘zgarishi natijasida uning hosil qiladigan ferment – substrat
kompleksining tabiati ham o‘zgaradi.
Shu sababli fermentativ katalizning pH optimum qiymatlari ferment va
substrat tabiatiga qarab turlicha chegara ko‘rsatkichlariga ega bo‘lishi mumkin.
Masalan, so‘lak amilazasining rN optimumi 6,9-7,0, papainniki esa 4-8, pepsinniki
esa 1,5-2,5 qiymatlar chegaralarida kuzatiladi.
Quyidagi rasmda fermentativ reaksiya tezligiga muhitning rN-ko‘rsatkichi
o‘zgarishlarining ta’siri tasvirlangan .
Fermentativ reaksiya tezligiga muhit pH -ko‘rsatkichi
qiymatining ta’siri.
Bu rasmdan ko‘rinib turibdiki, fermentativ reaksiya H +
ionlarining
konsentratsiyasining ma’lum bir qiymatlari oralig‘ida, yoki faol zona sohasida eng
kuchli tezlikda amalga oshadi. Faol zonadan oldinga yoki orqaga siljishlarda
fermentativ reaksiya tezligi 0 qiymatga qarab kamayib boradi. Muhitning rN-
ko‘rsatkichi qiymatining fermentativ reaksiya tezligiga bu ko‘rinishdagi ta’siri
reaksiya muhitida ionlanuvchi atom guruhlarining mavjudligi bilan bog‘liq bo‘ladi.
Muhitda N +
ionlari konsentratsiyasining o‘zgarishlari ferment molekulasining](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_23.png)
![ionlanish darajasiga ta’sir qilib, natijada fermentativ reaksiya tezligi faol zonadan
chetlashadi.
80-100 o
S haroratda ferment faolligi yo‘qoladi hamda bu jarayonni
quyidagicha tasvirlash mumkin:
Fermentativ reaksiya tezligiga harorat o‘zgarishlarining ta’sirini
ifodalovchi grafik.
Fermentativ reaksiyalar t = 40-60 0
S haroratda kuchli faollikka ega bo‘ladi.
Xar bir ferment uchun optimal harorat ko‘rsatkichi mavjud.
Fermentativ reaksiya tezligiga harorat o‘zgarishlarining ta’siri mexanizmi
quyidagicha tushintiriladi. Bunda haroratning keskin ortishi ferment molekulasida
denaturatsiya jarayonining kuchayishiga olib keladi va fermentativ reaksiya tezligi
pasayadi. Lekin ES kompleks hosil bo‘lishi ferment molekulasining harorat
o‘zgarishlariga chidamlilik darajasini oshiradi. Fermentativ reaksiyalarda oqsil
molekulasi - fermentdan tashqari, bir qator organik va anorganik moddalar, ya’ni
kofaktorlar ishtirok etadi.
6. Farmakokinetika va tibbiy fermentoterapiya asoslari. Tibbiyotga qator
aloqador masalalarni hal qilishda bevosita kinetik o‘lchov va hisoblash
uslublaridan foydalaniladi. Har qanday dorivor moddaning ta’sir effekti uning
kimyoviy tuzilishi, xossalari bilan bir qatorda ta’sir etish vaqti, konsentratsiya](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_24.png)
![qiymati, organlar orasidagi taqsimlanish, ular hosil qila oladigan metabolitlarning
faolligi va organizmdan (hujayra va to‘qimlardan) chiqib ketish vaqtiga bog‘liq
bo‘ladi.
Dorivor moddalarning organizmda vaqt birligi ichda taqsimlanishi, ta’sir
ko‘rsatish va organizmdan chiqib ketishini o‘rganadigan fan farmakokinetika deb
ataladi.
Farmakokinetik o‘lchashlarda, ko‘pincha birinchi tartiblikka ega bo‘lgan
jarayon teγnglamalaridan foydalaniladi:
dc/d τ =-kc va dP/d τ =-kP
bu yerda s – dastlabki modda va R – oxirgi metabolit konsentratsiyalari, k
– jarayonning tezlik doimiysining kamayish yig‘indisi bo‘lib, u preparatning
metabolitik (almashinuv) jarayon ( k
m ) va tashqi muhitga chiqarib yuborilish ( k
e )
hisobiga kelib chiqadigan kamayishining tezlik doimiyliklari yig‘indisiga teng
bo‘ladi: k=k
m +k
e .
Masalan, turli saraton kasalliklarini davolashda oksisiydikchildan
foydalaniladi. Uning miqdorini (c, mkg/ml) vaqt birligi ichida ( τ ) kamayishi
birinchi tartibli kinetik jarayon bo‘lib, rasmda keltirilgan ko‘rinishga ega bo‘ladi.
Og‘iz orqali berilgan oksisiydikchil konsentratsiyasini vaqt birligi
ichidagi kamayishi (A) va uning lg li chizmasi (V) (Akbarov, 1996).
Qator irsiy kasalliklar odam organizmida xossalari o‘zgargan fermentlar
sintezlanishiga olib keladi. Bunday kasalliklar tibbiyotda fermentoterapiya yoki
ekzimopatiyalar deb ataladi va ularning hozirgi kungacha 800 ga yaqin turi
ma’lumdir. Bunday kasalliklarga alkaptonuriya va albunizmni misol qilish](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_25.png)
![mumkin. Alkaptonuriyada odam organizmida fenilalaningidroksilaza va
gomogentizinaza fermentlari umuman sintezlanmasligi natijasida qon tarkibida
fenilalanin, fenilpirouzum kislotasi va boshqa moddalarning miqdori ortib ketadi.
Tog‘aylar ko‘k rangli, siydik jigarrang bo‘ladi. Tirazinaza fermenti
sintezlanmasligi hisobiga albinizm kasalligi paydo bo‘ladi va natijada tirozin
aminokislotasi rang beruvchi modda – melaninga aylana olmaydi.
Yuqorida aytilganlardan tashqari, amaliy tibbiyotda qator kasalliklarni
davolashda fermentlardan yoki ularni saqlovchi preparatlardan foydalaniladi va bu
uslub fermentoterapiya (enzimoterapiya) deb ataladi. Masalan, qoramollarning
mentlari bronxit, pnevmoniya (o‘pka va nafas yo‘llaridagi shilimshiq modda va
ekssudatlarni yo‘qotishda), tromboflebitlarda (yallig‘lanishga qarshi) va teri
kuyishida (sepki dori sifatida) foydalaniladi. Bundan tashqari E. Coli dan ajratib
olingan va L-asparaginaza deb atalgan ferment turli saraton kasalliklarini
(limfasarkoma, limfoblast leykozi) davolashda ishlatiladi.
Ba’zi kasalliklarda ferment falligi oshib ketadi va bunda ingibitor xossali
moddalardan foydalaniladi. Bular jumlasiga fibrinoliz (qon suyulib ketishi)
ingibitori bo‘lgan -aminokapron kislota va amben deb atalgan dori moddalariniɛ
keltirish mumkin. Ular intifibinolik dorivor moddalar turkumiga tegishli bo‘lib,
plazminogenni faollashtiruvchi fermentlarni raqobatli ingibirlaydi va qon ivishini
kuchaytiradi. Hozirda tibbiyotda qo‘llaniladigan va tarkibida ferment yoki ferment
ingibitorlari saqlovchi dorivor moddalar soni 40 dan oshadi.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_26.png)
![ADABIYOTLAR
1.Ярмоне нко С.П., Вайнсо н А.А. Радиобиология человека
нживотных.
М., "Высшая школа", 2004.
2.
Remizov .Tibbiy va biologik biofizika. Toshkent Ibn Sino nashriyoti
,2006.
3.
Yu.B. Kudryashov. Radiaщyunnaya bi ofiz ika ( ionnziruyush ie
izlucheniya). Moskva, Fizmatlit.2004.
4. Ye
. Ismoilov, N. Mamatqulov, G‘. Xodjaev, Q.Norboev, Biofizika
va radiobiologiya, Sano-standart nashriyoti, Toshkent-2018.
5.
Radjabov A.I. Radiobiologiya, “Fan va texnologiya” Toshkent-
2018
6.
Umarova F.T. Universitet. 2003.](/data/documents/c466e326-86f5-4311-8ac0-3b9f7f21ea42/page_27.png)
Biologik jarayonlar kinetikasi. Reaksiya tezligiga ta`sir etuvchi omillar. Fermentativ reaksiyalar Reja: 1. Kimyoviy jarayonlarning molekulyarligi va tartibi. Gunberg-Vaage qoidasi. 2. Biologik jarayonlarni matematik modellash prinsiplari. 3. Dinamik sistemalarni tasvirlovchi matematik modellar, ularning geometrik yechimlari. 4. Kimyoviy jarayonlar tezligiga kontsentratsiyaning ta’siri. 5. Kimyoviy jarayonlar tezligiga haroratning ta’siri. 6. Fermentativ reaksiyalar kinetikasi. Mixaelis-Menten tenglamasi. 7. Fermentativ katalizga pHning ta’siri. Farmakokinetika va tibbiy fermentoterapiya asoslari.
Kimyoviy jarayonlarning tezligiga ta’sir etadigan qonuniyatlarni, turli faktorlarning jarayon tezligiga va mexanizmiga ta’sir etishini kimyoviy kinetika o‘rganadi. O‘z navbatida kinetikaning ikki bo‘limi o‘zaro farqlanadi: 1) kimyoviy jarayonning borish mexanizmini hisobga olmagan holda uning tezligini matematik ifodalashni o‘rganadigan bo‘limi – formal kinetika deyiladi; 2) kimyoviy jarayonlarning borish mexanizmlarini o‘rganishga bag‘ishlangan bo‘limi – molekulyar kinetika deyiladi. 1. Kimyoviy jarayonlarning molekulyarligi va tartibi. Har qanday kimyoviy jarayonlar ko‘p miqdordagi elementar aktlardan iborat. Reaksiyada ishtirok etayotgan molekulalarning soni turlicha bo‘lishi mumkin. Reaksiyada bevosita ishtirok etayotgan molekulalar soni uning molekulyarligini belgilaydi: Kimyoviy jarayonning elementar aktini (ta’sirlashuvini) hosil qiladigan molekulalarning eng kichik soni jarayonning molekulyarligi deyiladi va u butun sonlar qiymatiga teng bo‘ladi. Kimyoviy jarayonlar bir, ikki va uch molekulyar bo‘lishi mumkin: 1. Bir molekulyar (monomolekulyar) kimyoviy jarayonlarda bitta dastlabki molekula bir yoki bir necha reaksiya mahsulotiga aylanishi mumkin. Bu quyidagi umumiy tenglama bilan ifodalanadi: A→B; A→B+C; A→B+C+D. 2. Ikki molekulyar (bimolekulyar) kimyoviy jarayonlarda dastlabki mahsulotlar sifatida 2 mol bir xil yoki turli xil moddalar ishtirok etadi. 2A→B+C; A+B→C+D. 3. Uch molekulyar kimyoviy jarayonlarda bir vaqtning o‘zida 3 ta molekula o‘zaro to‘qnashishi kerak. Bu reaksiyaning ehtimolligi kichik. Shu sababli kam hollarda kuzatiladi: 2A+B→C Molekulyarligi uchdan yuqori bo‘lgan reaksiyalar ma’lum emas. Kinetikada kimyoviy reaksiyalar birinchi, ikkinchi, uchinchi, nolinchi va kasr tartibli reaksiyalarga bo‘linadi. Reaksiya tartibi reaksiya tezligini ifodalovchi tenglamadagi reagentlar konsentratsiyasi darajalarining yig‘indisidan iborat
kattalik hisoblanadi. Agar reaksiya tezligi reaksiyaga kirishuvchi bitta moddaning konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lsa, bu reaksiya birinchi tartibdagi reaksiya deb ataladi: dP/dt = k[A] 1 (1.1) Reaksiya tezligi reaksiyaga kirishuvchi ikkita moddaning konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lsa, bu reaksiya ikkinchi tartibdagi reaksiya deb ataladi: dP/dt = k[A] 2 yoki dP/dt = k[A]·[B] 1 (1.2) Ikkinchi tartibdagi reaksiya ikkinchi tartib kinetika asosida boradi. dP/dt = k[A] 2 ·[B] 3 ·[C] 2 reaksiya esa yettinchi tartibli reaksiyadir, chunki reagentlar konsentratsiyasining yig‘indisi (2+3+2=7) yettiga teng. Kinetik tenglamada konsentratsiya ko‘rsatilmзagan bo‘lsa, ya’ni tezligi reaksiyaga kirishuvchi moddalar konsentratsiyasiga bog‘liq bo‘lmasa, bunday reaksiya nolinchi tartib reaksiya deb ataladi va dP/dt = k 0 ko‘rinishida ifodalanadi. Gunberg-Vaage qoidasi. Odatda jarayonning molekulyarligi va tartibi bir bosqichli oddiy reaksiyalardagina o‘zaro mos keladi. Kimyoviy kinetika nazariyasi asosida kimyoviy reaksiyalar tezligi reaksiya kirishuvchi reagentlarning faol massasiga proporsionaldir, deb ta’kidlovchi Gunberg-Vaage fundamental qoidasi yetadi. Bu qoidani reaksiyaning umumiy tezligini tasvirlovchi ifodaga qo`llash har bir faol massa yoki faollikni (misolimizda konsentrasiyani) re aksiyaning stexnometrik tenglamasidagi koeffisiyentiga mos keladi gan darajaga ko’tarishga olib keladi. Eng oddiy misol sifatida quyidagi reaksiyani olamiz:A k B 1 ( mahsulot) . A moddalilg parchalanish tezligi uning konsentrasiyasiga [A] ga mutanosibdir, ya’ni : v = d[B]/dt = k 1 [A]. Bordi-yu, mA + nB ⃗ 2ò ko’rinishidagi reaksiya olinsa, uning tezligi [A] m va [B] n ko’paytirmasiga proporsionan bo’ladi, ya’ni -dP/dt = k 2 [A] m [B] n
tenglamalardagi propor sionallik koeffisiyenti bo’lmish k 2 - reaksiyaning tezlik konstantasini ifodalab, u olingan reagentlar konsentrasiyasi birga teng bo’lgan shartidagi reaksiyaning tezligini aks etitiradi. Tenglamani oldiga qo’yilgan " -" belgi, reaksiya tezligining vaqt e’tibori bilan ka maya borishini ifodalaydi. To’g’ri va teskari yo’lalishdagi reaksiyalar tezlik konstantalarining nisbati k muv = k +1 /k -1 muvozanat konstantasi deb atalib, k +1 > k -1 sharoitda, u to’g’ri reaksiyaning teskari reaksiyadan ustun lik olishini bildiradi. 2. Biologik jarayonlarni matematik modellash prinsiplari. Ochiq biologik sistemalarning eng muhim o‘ziga xosliklaridan biri, ularda statsionar holatning (sistema parametrlari doimiyligining) qaror topishidir. Statsionar holatlararo o‘tish jarayonlarining kinetik tiplari o‘zaro farqlanadi: overshut (oshiqcha chetlashish), yolg‘on start va tebranmali rejim. Ochiq sistemalarning bunday xossasini oddiy kirish va chiqish qismlarda klapanlari bor, hamda aks aloqa sistemasi bilan ta’minlangan suvli rezervuarlardan iborat Barton gidrodinamik modelida namoyish etish mumkin. Qaysiki, unda o‘sha soddalashtirilgan model tirik hujayradagi statsionar holatning saqlanishini ta’minlovchi kinetik mexanizmlarning deyarli hamma analoglari mavjud. Ammo biologik sistemalar hatti-harakatini matematik modellash muammolari ancha murakkabdir. Quyida biz biologik jarayonlar kinetikasi hamda ularning muhim xossalarini modellashga doir asosiy qoidalar va yondashishlarni ko‘rib chiqamiz. Biologik jarayonlar kinetikasi biofizikaning bir bo‘limi sifatida sistema tarkibiy qismlari ta’sirlashishlariga doir ma’lum bo‘lgan qonuniyatlar asosida uning hatti-harakatini zamonda tekshirish bilan shug‘ullanadi. Kinetik sistemani o‘lchanishi mumkin bo‘lgan kattaliklar orqali ifodalangan vaqtning har bir momentida, muayyan son kattaliklariga ega bo‘luvchi o‘zgaruvchi kattaliklar va bir qator parametrlar majmuasi tarzda xarakterlash mumkin. Parametrlar sistema ustida o‘tkazilayotgan kuzatishlar davomida o‘zgarmasdan saqlanadigan kattaliklardir, vaqt davomida o‘zgaradigan kattaliklar o‘zgaruvchilardir. Biologik sistemalardagi o‘zgaruvchi kattaliklarga o‘lchanishi mumkin bo‘lgan kattaliklar: biokimyoda – metabolitlar konsentratsiyasi, mikrobiologiyada
– mikroorganizmlar soni yoki ularning biomassasi, ekologiyada – turlarning soni, biofizikada – membranada sodir bo‘ladigan jarayonlar, membarana potensiali kattaligi va hokazo. Parametrlarga esa, harorat, rN, membrananing elektr sig‘imi, namlik, va hokazolar misol bo‘ladi. So‘nggi paytlargacha biologiyada qo‘llanilib kelingan matematik modellar quyidagi ko‘rinishga ega. dC 1 /dt=f 1 (C 1 ,C 2 ,C 3 …..C n ,t); dC 2 /dt=f 2 (C 1 ,C 2 ,C 3 …..C n ,t); …………………………… dC n /dt=f n (C 1 ,C 2 ,C 3 …..C n ,t) Oxirgi natijada masalaning yechimlarini analitik yo‘l bilan hosil qilish mumkin bo‘lgan chiziqli differensial tenglamalarga borib taqaladi. Bu yerda S 1 (t), ….C n (t) – sistema o‘zgaruvchi kattaliklarini tasvirlovchi vaqtning noma’lum funksiyalari (masalan, modda konsentratsiyasi), dC n /dt – o‘sha o‘zgaruvchi kattalikning o‘zgarish tezligi f n – ichki va tashqi omillarga bog‘liq funksiya belgisi. Ma’lumki, real kimyoviy jarayonlar ikkinchi va undan yuqori tartibga ega reaksiyalarni o‘z ichiga oladi. Bu tip reaksiyalar tenglamalarining o‘ng tomonidagi nochiziq hadlar ularning tahlilini ancha murakkablashtirsa ham sistemaning matematik xossalarini ancha boyitadi. Dastlabki tenglamalar sistemasini soddalashtirish maqsadida quyidagi yondoshuvlardan foydalaniladi: A) Tenglamalar sonini qisqartirish. Sistema statsionar holatlarning bir qator muhim xossalarini, tenglamalarning aniq analitik yechimlari emas, balki ularning o‘ng tomon xossalarini tekshirish orqali oshkor etish mumkin. Yuqorida keltirilgan tenglamalar sistemasidan iborat modellar umumiy xarakterga ega bo‘lib, muhimi shundaki, tuzilgan model kechayotgan jarayonni to‘la aks ettira olishi lozim. Boshqacha aytganda, tenglamalar sistemasi modellanuvchi sistemaning dinamik strukturasiga to‘la mos kelishi kerak. Umuman bunday metod ko‘pincha ikki tenglamadan iborat modellar bilan ish ko‘rganda yaxshi natija beradi. Tenglamalar sonini kamaytirish hohish bo‘yicha emas, balki obyektiv